RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 SLC1A1P43005 524 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SGO2Q562F6 1265 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 NSMFQ6X4W1 530 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SV2AQ7L0J3 742 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 GPD1LQ8N335 351 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 POMGNT1Q8WZA1 660 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 RMDN3Q96TC7 470 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 HOMER2Q9NSB8 354 aa27.63■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 IRF6O14896 467 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 CLDN3O15551 220 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ITIH2P19823 946 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 KCNJ1P48048 391 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SLC39A4Q6P5W5 647 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ANO5Q75V66 913 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ANKS4BQ8N8V4 417 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 GRK7Q8WTQ7 553 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SMIM23A6NLE4 172 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ABCD1P33897 745 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 AUHQ13825 339 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ITIH4Q14624 930 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 CCT6BQ92526 530 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 OPTNQ96CV9 577 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SLC10A4Q96EP9 437 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ANAPC7Q9UJX3 599 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa27.62■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 DLATP10515 647 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 KRT5P13647 590 aa27.61■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 RTP1P59025 263 aa27.61■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 KRT17Q04695 432 aa27.61■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 PPIL2Q13356 520 aa27.61■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.61■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SLC40A1Q9NP59 571 aa27.61■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 FDX1P10109 184 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 UNGP13051 313 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 MNAT1P51948 309 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 CAV1Q03135 178 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 PTK6Q13882 451 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ARHGEF16Q5VV41 709 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 PIGWQ7Z7B1 504 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 MCOLN2Q8IZK6 566 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 BSNDQ8WZ55 320 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 KLC4Q9NSK0 619 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 DNM1LO00429 736 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 CXCL11O14625 94 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ZBED4O75132 1171 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 BPIFB4P59827 614 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 RHBDF2Q6PJF5 856 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 NLRX1Q86UT6 975 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 GPRASP2Q96D09 838 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SNF8Q96H20 258 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SERPINB12Q96P63 405 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 C1orf112Q9NSG2 853 aa27.6■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 H0YCG3 227 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ATP5DP30049 168 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 PTP4A2Q12974 167 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 CST9Q5W186 159 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 MCPH1Q8NEM0 835 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ATP6V0A1Q93050 837 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 CEP170P1Q96L14 293 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 KIAA1586Q9HCI6 787 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 CCT8L1PA6NM43 557 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 MAFGO15525 162 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SCP2P22307 547 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 CCND2P30279 289 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SCTRP47872 440 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.011e-6■■■□□ 18.6
OPN3-204ENST00000469376 CCDC25Q86WR0 208 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 C1orf54Q8WWF1 131 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 HOMER3Q9NSC5 361 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 ASIC3Q9UHC3 531 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 KCNH4Q9UQ05 1017 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa27.59■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa27.58■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 SAMD15Q9P1V8 674 aa27.58■■■□□ 2.01
OPN3-204ENST00000469376 MROH7Q68CQ1 1323 aa27.58■■■□□ 2
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
OPN3-204ENST00000469376 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
OPN3-204ENST00000469376 GAS8O95995 478 aa27.57■■■□□ 2
OPN3-204ENST00000469376 CENPCQ03188 943 aa27.57■■■□□ 2
OPN3-204ENST00000469376 CNGA2Q16280 664 aa27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.8 ms