RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 STPG1Q5TH74 334 aa4.71□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC6A19Q695T7 634 aa4.71□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 VHLLQ6RSH7 139 aa4.71□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 LINC00114Q6XXX2 140 aa4.71□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.71□□□□□ -1.66
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ECHDC1-211ENST00000460558 CHST3Q7LGC8 479 aa4.71□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF605Q86T29 641 aa4.71□□□□□ -1.66
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ECHDC1-211ENST00000460558 HOMER1Q86YM7 354 aa4.71□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.71□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM11Q96F44 468 aa4.71□□□□□ -1.66
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ECHDC1-211ENST00000460558 NYAP2Q9P242 653 aa4.71□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
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ECHDC1-211ENST00000460558 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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ECHDC1-211ENST00000460558 UBXN2BQ14CS0 331 aa4.7□□□□□ -1.66
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ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.7□□□□□ -1.66
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ECHDC1-211ENST00000460558 SLC44A3Q8N4M1 653 aa4.7□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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ECHDC1-211ENST00000460558 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.7□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.7□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.7□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.7□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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ECHDC1-211ENST00000460558 EML5Q05BV3 1969 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 GON4LQ3T8J9 2241 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM170BA6NMN3 283 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM232C9JQI7 657 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 J3QKU1 62 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 NCAM2O15394 837 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 UBOX5O94941 541 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 GNAT1P11488 350 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 LAG3P18627 525 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 EDNRBP24530 442 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 CALML3P27482 149 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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ECHDC1-211ENST00000460558 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT17Q04695 432 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 NKG7Q16617 165 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 LY6KQ17RY6 165 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 DUOXA2Q1HG44 320 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 LETM2Q2VYF4 491 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 BBS9Q3SYG4 887 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF787Q6DD87 383 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 IGF2-ASQ6U949 168 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.69□□□□□ -1.66
ECHDC1-211ENST00000460558 Q6ZS46 218 aa4.69□□□□□ -1.66
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