RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT7	P08729	469 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	POU2F2	P09086	479 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CD1E	P15812	388 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GLDC	P23378	1020 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	VIPR2	P41587	438 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	IGBP1	P78318	339 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SGF29	Q96ES7	293 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	IWS1	Q96ST2	819 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM245	Q9H330	911 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GAREM1	Q9H706	876 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	IL21R	Q9HBE5	538 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	THSD1	Q9NS62	852 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GMIP	Q9P107	970 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	PNMA2	Q9UL42	364 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	MYLK	Q15746	1914 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	N4BP3	O15049	544 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GNS	P15586	552 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	MATK	P42679	507 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC1A4	P43007	532 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GRK6	P43250	576 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF33A	Q06730	810 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	DSC3	Q14574	896 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SV2A	Q7L0J3	742 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB119	Q8N690	84 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	MBOAT7	Q96N66	472 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	MMS19	Q96T76	1030 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CASS4	Q9NQ75	786 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR70	Q9NW82	654 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR27	A2RRH5	827 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	PLA2G6	O60733	806 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ALDH1A2	O94788	518 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	EGF	P01133	1207 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	FECH	P22830	423 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	DSG1	Q02413	1049 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CREM	Q03060	361 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO43	Q4G163	708 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	FRMD1	Q8N878	549 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	MYH4	Q9Y623	1939 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	NCAN	O14594	1321 aa		7.27	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR64	B1ANS9	1081 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MPO	P05164	745 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	C1S	P09871	688 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	GABRE	P78334	506 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	LTB	Q06643	244 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PTPA	Q15257	358 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TBR1	Q16650	682 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM228A	Q86W67	206 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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