RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.17■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 HSCBQ8IWL3 235 aa25.17■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 BICD1Q96G01 975 aa25.17■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 UROC1Q96N76 676 aa25.17■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 CLSTN3Q9BQT9 956 aa25.17■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 STK17AQ9UEE5 414 aa25.17■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 A0A087X0B3 334 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 I3L4J1 428 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 CITO14578 2027 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 ADAM12O43184 909 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 FGFR3P22607 806 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 BRCC3P46736 316 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 ZXDAP98168 799 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 CREMQ03060 361 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 PSMD5Q16401 504 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.16■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 PIGRP01833 764 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 CXCL8P10145 99 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 LIG4P49917 911 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 PTPN21Q16825 1174 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 SLC39A4Q6P5W5 647 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 DYMQ7RTS9 669 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TMEM130Q8N3G9 435 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.15■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 MYMKA6NI61 221 aa25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 FAM189A1O60320 539 aa25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 C1RP00736 705 aa25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TKTP29401 623 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TXLNAP40222 546 aa25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TNFSF9P41273 254 aa25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.627e-24■■■■□ 21.7
PSME4-208ENST00000481518 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 HDAC7Q8WUI4 952 aa25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TECTAO75443 2155 aa25.14■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 PODXLO00592 558 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 PAPLNO95428 1278 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 GTF2BQ00403 316 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 SPAG1Q07617 926 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 TRIM67Q6ZTA4 783 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 CCDC149Q6ZUS6 474 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 HFE2Q6ZVN8 426 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 SFR1Q86XK3 245 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 DDX12PQ92771 950 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 PANK2Q9BZ23 570 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 DPP7Q9UHL4 492 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 USTQ9Y2C2 406 aa25.13■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 TTC26A0AVF1 554 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 CLTAP09496 248 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 SCP2P22307 547 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 STK38Q15208 465 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 MTRRQ9UBK8 725 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 FBXW11Q9UKB1 542 aa25.12■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 A0A0B4J269 797 aa25.11■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 TISP43B9A030 160 aa25.11■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa25.11■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.11■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.11■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 TMEM221A6NGB7 291 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 ANKRD63C9JTQ0 380 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 M0R296 226 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 SPTLC2O15270 562 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 OGTO15294 1046 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 ASGR2P07307 311 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 STAT6P42226 847 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 PKP1Q13835 747 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 PDXDC1Q6P996 788 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.1■■□□□ 1.61
PSME4-208ENST00000481518 SV2BQ7L1I2 683 aa25.1■■□□□ 1.61
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