RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477234.1

SBF1-208, Transcript of SET binding factor 1, human

TSL 5

Gene SBF1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF1-208	ENST00000477234	PSMD10	O75832	226 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	AKAP3	O75969	853 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	FNTB	P49356	437 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	FUT2	Q10981	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PTGDR	Q13258	359 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234		Q4G0T1	1027 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	VPS45	Q9NRW7	570 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	EPN2	O95208	641 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	CHRNB1	P11230	501 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	PDC	P20941	246 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	SATB1	Q01826	763 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	SCRN1	Q12765	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	ANO5	Q75V66	913 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	YAF2	Q8IY57	180 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	ING5	Q8WYH8	240 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	NOTCH4	Q99466	2003 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	STBD1	O95210	358 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	LARGE1	O95461	756 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	TH	P07101	528 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	GDI1	P31150	447 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	OR1D2	P34982	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	PTEN	P60484	403 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	WASF1	Q92558	559 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	IGF2R	P11717	2491 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	PRRG1	O14668	218 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	AXIN1	O15169	862 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	TSPAN1	O60635	241 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	ATG13	O75143	517 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	C1QTNF9	P0C862	333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	CEACAM1	P13688	526 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	IFNAR1	P17181	557 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	PTPA	Q15257	358 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	MTR	Q99707	1265 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	LHX6	Q9UPM6	363 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	HES2	Q9Y543	173 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234		F8W810	466 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234		K7ESF4	209 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SBF1-208	ENST00000477234	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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