RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462025.1

RBM5-211, Transcript of RNA binding motif protein 5, human

TSL 4

Gene RBM5, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM5-211	ENST00000462025	FZD5	Q13467	585 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	MAPK6	Q16659	721 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	XYLB	O75191	536 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	B3GAT3	O94766	335 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	RPA1	P27694	616 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ZNF174	Q15697	407 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	UPP1	Q16831	310 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	RUBCN	Q92622	972 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	SHD	Q96IW2	340 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	RHO	P08100	348 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	CEBPB	P17676	345 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	FCAR	P24071	287 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ANAPC15	P60006	121 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ROR1	Q01973	937 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	MYH11	P35749	1972 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ABLIM1	O14639	778 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ECI2	O75521	394 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	SEC24A	O95486	1093 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	CCR2	P41597	374 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	OSTN	P61366	133 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	NBR1	Q14596	966 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	NELL1	Q92832	810 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	CDT1	Q9H211	546 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ANK1	P16157	1881 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	NCAN	O14594	1321 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	LILRB5	O75023	590 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ABLIM3	O94929	683 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	TRIM29	Q14134	588 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	GRM2	Q14416	872 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	DAW1	Q8N136	415 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	PODXL	O00592	558 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	MOSPD3	O75425	235 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	GRM5	P41594	1212 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM5-211	ENST00000462025	ARPP19	P56211	112 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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