RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300013.8

SAAL1-201, Transcript of serum amyloid A like 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene SAAL1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAAL1-201ENST00000300013 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SAAL1-201ENST00000300013 VPS36Q86VN1 386 aa20.08■□□□□ 0.81
SAAL1-201ENST00000300013 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.08■□□□□ 0.81
SAAL1-201ENST00000300013 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.08■□□□□ 0.81
SAAL1-201ENST00000300013 WBP1LQ9NX94 342 aa20.08■□□□□ 0.81
SAAL1-201ENST00000300013 LRRN2O75325 713 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 GFPT2O94808 682 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 NPTXRO95502 500 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TNNT1P13805 278 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 GCNT1Q02742 428 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 CD302Q8IX05 232 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TMEM192Q8IY95 271 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 HELQQ8TDG4 1101 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 GPR88Q9GZN0 384 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 NOD1Q9Y239 953 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TRIP11Q15643 1979 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 KBTBD13C9JR72 458 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 EVI5O60447 810 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 VNN1O95497 513 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 PTK7Q13308 1070 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 NCOA4Q13772 614 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 KIAA1328Q86T90 577 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 LACTBL1A8MY62 500 aa20.06■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 PTK2Q05397 1052 aa20.06■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.06■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.06■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.06■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.06■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.06■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 A0A1W2PQY0 241 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TRPC3Q13507 836 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 SLC18A3Q16572 532 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 SHC3Q92529 594 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TATDN2Q93075 761 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 FAM84AQ96KN4 292 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.88e-16■■■■■ 372.6
SAAL1-201ENST00000300013 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 PHF24Q9UPV7 400 aa20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 CAND2O75155 1236 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 RPS6KA5O75582 802 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 THPOP40225 353 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 VAV2P52735 878 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 MGAT3Q09327 533 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 JADE1Q6IE81 842 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 FAM228AQ86W67 206 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 KAT5Q92993 513 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 WNT8BQ93098 351 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 C2CD2Q9Y426 696 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.04■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 CHRNA1P02708 482 aa20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 CTSHP09668 335 aa20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 USP8P40818 1118 aa20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 CYP27A1Q02318 531 aa20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 DERAQ9Y315 318 aa20.03■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 ZNF263O14978 683 aa20.02■□□□□ 0.8
SAAL1-201ENST00000300013 GPR182O15218 404 aa20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms