RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ATL2Q8NHH9 583 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 URGCPQ8TCY9 931 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 TTI1O43156 1089 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXD10P28358 340 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS7P49802 495 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ARSEP51690 589 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 COG7P83436 770 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 IER5Q5VY09 327 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 CTSHP09668 335 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 NR1H3Q13133 447 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 HBP1O60381 514 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 PDGFRAP16234 1089 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 EPC2Q52LR7 807 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 P4HA2O15460 535 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP2R2AP63151 447 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 TBX20Q9UMR3 447 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKS1AQ92625 1134 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 CDC42EP1Q00587 391 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0G2JND7 137 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 RGL2O15211 777 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 AP1B1Q10567 949 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 WEE2P0C1S8 567 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 NCAPHQ15003 741 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 HVCN1Q96D96 273 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 GCNAQ96QF7 691 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 NFIBO00712 420 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 EXTL3O43909 919 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM253P0C7T8 217 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM51Q9BSJ1 452 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 BFARQ9NZS9 450 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ALG6Q9Y672 507 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT10P13645 584 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 GIT2Q14161 759 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 AFG1LQ8WV93 481 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS11Q9H270 941 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 MAPK13O15264 365 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 CASP4P49662 377 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 MCEEQ96PE7 176 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRJ-208ENST00000615445 PAMP19021 973 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 KLC3Q6P597 504 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 PDGFRBP09619 1106 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 COMTP21964 271 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 ERVK-24P63145 666 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC12A1Q13621 1099 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPPQ6IPU0 288 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A087X0T9 212 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 H3BRJ5 948 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM228BP0C875 321 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 FGFR4P22455 802 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 DDR1Q08345 913 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 E2F5Q15329 346 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms