RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 NLRP3Q96P20 1036 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 LRRC37BQ96QE4 947 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 GAKO14976 1311 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 FOXO6A8MYZ6 492 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 ZBTB5O15062 677 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 P4HA2O15460 535 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 RSPH10BP0C881 870 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 EPHB2P29323 1055 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 RPS8P62241 208 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 KCNA1Q09470 495 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 GSTA3Q16772 222 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 ANKRD35Q8N283 1001 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 PCDHB18PQ96TA0 734 aa10.56□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 TM4SF1P30408 202 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 ITGA8P53708 1063 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 AP3B2Q13367 1082 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 EPC2Q52LR7 807 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 TRIM68Q6AZZ1 485 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 KCNK9Q9NPC2 374 aa10.56□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 STOML1Q9UBI4 398 aa10.56□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 DNAJC6O75061 913 aa10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 LDHCP07864 332 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 MARK3P27448 753 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 EVA1CP58658 441 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 MYL7Q01449 175 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 PTP4A2Q12974 167 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 TCERG1LQ5VWI1 586 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 DTNBP1Q96EV8 351 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 VCXQ9H320 206 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 MLXIPLQ9NP71 852 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 UVRAGQ9P2Y5 699 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 AP1B1Q10567 949 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 SNX1Q13596 522 aa10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 ERMNQ8TAM6 284 aa10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 UCMAQ8WVF2 138 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 PTPRN2Q92932 1015 aa10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 DCLK3Q9C098 648 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa10.55□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 EML1O00423 815 aa10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 RFC5P40937 340 aa10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 C1orf186Q6ZWK4 172 aa10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 PSTPIP2Q9H939 334 aa10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 GTF3C4Q9UKN8 822 aa10.55□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa10.54□□□□□ -0.72
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HCG18-242ENST00000602319 CEP128Q6ZU80 1094 aa10.54□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 VSIG1Q86XK7 387 aa10.54□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 FAM71AQ8IYT1 594 aa10.54□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 BBOF1Q8ND07 529 aa10.54□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 FAM20AQ96MK3 541 aa10.54□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 BCAS3Q9H6U6 928 aa10.54□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 PPCSQ9HAB8 311 aa10.54□□□□□ -0.72
HCG18-242ENST00000602319 PCMTD2Q9NV79 361 aa10.54□□□□□ -0.72
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