RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLIPR1P48060 266 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 COMPP49747 757 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 VAV2P52735 878 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 GFRA1P56159 465 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 BFSP2Q13515 415 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 PWP1Q13610 501 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 XKR6Q5GH73 641 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 VWA1Q6PCB0 445 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 POMZP3Q6PJE2 187 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 THNSL2Q86YJ6 484 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 RHOT2Q8IXI1 618 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASB15Q8WXK1 588 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZSWIM1Q9BR11 485 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 PYGO2Q9BRQ0 406 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM204Q9BSN7 226 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR27Q9NS67 375 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ING3Q9NXR8 418 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GUV1 79 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR27A2RRH5 827 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD34BA5PLL1 514 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRAMEF25A6NGN4 478 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYT5O00445 386 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMY2AP04746 511 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 FGF2P09038 288 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMY2BP19961 511 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC7A5Q01650 507 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 APOBRQ0VD83 1088 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC1A5Q15758 541 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 TXNRD1Q16881 649 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q7L0L9 218 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRT77Q7Z794 578 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF169Q8NCN4 708 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL17RAQ96F46 866 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 C5orf34Q96MH7 638 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 HAPLN3Q96S86 360 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC7A10Q9NS82 523 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHL13Q9P2N7 655 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLCA2Q9UQC9 943 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOX1Q9Y5S8 564 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF318Q5VUA4 2279 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 VWC2LB2RUY7 222 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 FCHO1O14526 889 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF213O14771 459 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ORC4O43929 436 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAH10OSP0CZ25 163 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHN2P52757 468 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 NBPF8Q3BBV2 869 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPDYE7PQ495Y7 208 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 FIGNQ5HY92 759 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPINK14Q6IE38 97 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA1211LQ6NV74 962 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR48Q8TAF3 677 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 LMO3Q8TAP4 145 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR92Q96MX6 357 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD93Q9NPY3 652 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 POT1Q9NUX5 634 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAI1Q9UI46 699 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 HDAC5Q9UQL6 1122 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 LDB3O75112 727 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 RASGRP1O95267 797 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPP00450 1065 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 FGFR4P22455 802 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAPK1P28482 360 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 DGKDQ16760 1214 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 FSTL4Q6MZW2 842 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 LBX2Q6XYB7 198 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 NLGN4XQ8N0W4 816 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM43AQ8N2R8 423 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 HEY2Q9UBP5 337 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNE5Q9UJ90 142 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP23Q9Y6H3 246 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GTW7 788 aa0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms