RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477234.1

SBF1-208, Transcript of SET binding factor 1, human

TSL 5

Gene SBF1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF1-208	ENST00000477234	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	TM4SF5	O14894	197 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CCL16	O15467	120 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CHMP2A	O43633	222 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PFKFB2	O60825	505 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CDKL5	O76039	1030 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	MICAL2	O94851	1124 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	MLH1	P40692	756 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	RFC5	P40937	340 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	SCNN1G	P51170	649 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PSMC5	P62195	406 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CUL4A	Q13619	759 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PSMD5	Q16401	504 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	NID2	Q14112	1375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CPLX1	O14810	134 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	GDF9	O60383	454 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	TFDP1	Q14186	410 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	ME3	Q16798	604 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	SLC5A5	Q92911	643 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	COL26A1	Q96A83	441 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	MSH4	O15457	936 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	HR	O43593	1189 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	KCNK5	O95279	499 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PTPN2	P17706	415 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PSMC3	P17980	439 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	NTHL1	P78549	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	RAB33A	Q14088	237 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	UGCG	Q16739	394 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	STPG1	Q5TH74	334 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	LRG1	P02750	347 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	RHO	P08100	348 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	ELF1	P32519	619 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	STK3	Q13188	491 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	TUSC3	Q13454	348 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	LENG9	Q96B70	501 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF263	O14978	683 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SBF1-208	ENST00000477234	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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