RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 LINGO3P0C6S8 592 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CSRP3P50461 194 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RTP1P59025 263 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NEDD9Q14511 834 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SMYD5Q6GMV2 418 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM179Q6ZVK1 233 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 EMSYQ7Z589 1322 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF541Q9H0D2 1346 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DENND3A2RUS2 1198 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 VNN1O95497 513 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP4AP20648 1035 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ARRB2P32121 409 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE6CP51160 858 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CREB5Q02930 508 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC47A2Q86VL8 602 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 OTUD6BQ8N6M0 293 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DYDC2Q96IM9 177 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DCLK3Q9C098 648 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PARVGQ9HBI0 331 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINA10Q9UK55 444 aa3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC169A6NNP5 214 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CALCAP01258 141 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MSS51Q4VC12 460 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SOGA3Q5TF21 947 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52E8Q6IFG1 317 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 C10orf82Q8WW14 230 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NRG4Q8WWG1 115 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC45AQ9H3U1 944 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 PTPN7P35236 360 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ANO7Q6IWH7 933 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TMC2Q8TDI7 906 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SPIRE2Q8WWL2 714 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 POMGNT1Q8WZA1 660 aa3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 AZI2Q9H6S1 392 aa3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 MAP2K2P36507 400 aa3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC38Q502W7 563 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NIPA1Q7RTP0 329 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DNM3Q9UQ16 869 aa3.89□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TTLL13PA6NNM8 815 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PES1O00541 588 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NOMO3P69849 1222 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ICA1Q05084 483 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DSTYKQ6XUX3 929 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SYCE1Q8N0S2 351 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 WDTC1Q8N5D0 677 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGRP01833 764 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP8P22894 467 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE6BP35913 854 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE4CQ08493 712 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TRNP1Q6NT89 227 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 KIRREL3Q8IZU9 778 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINB12Q96P63 405 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM237Q96Q45 408 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 LXNQ9BS40 222 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PHACTR1Q9C0D0 580 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNH7Q9NS40 1196 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 AMFRQ9UKV5 643 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ALOX15BO15296 676 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 HIP1RO75146 1068 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GABBR2O75899 941 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM63AO94886 807 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPNS1P04632 268 aa3.88□□□□□ -1.79
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