RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 CIAPIN1Q6FI81 312 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 TADA2BQ86TJ2 420 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 LPAR1Q92633 364 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.74■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 CLSTN1O94985 981 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 CTNNA2P26232 953 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 RXRBP28702 533 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SNX1Q13596 522 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 RAB17Q9H0T7 212 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SLCO1A2P46721 670 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 MFAP3P55082 362 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 CYP24A1Q07973 514 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SLC29A2Q14542 456 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SEZ6Q53EL9 994 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 FBXL13Q8NEE6 735 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 HAPLN2Q9GZV7 340 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16.73■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 KCNA2P16389 499 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 GPC3P51654 580 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 PMS2P54278 862 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 HMGCS2P54868 508 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 PPP2R2AP63151 447 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 HACL1Q9UJ83 578 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 GJB6O95452 261 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 CYP1A2P05177 515 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 ACOT2P49753 483 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 JAK3P52333 1124 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 CDR2Q01850 454 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SP2Q02086 613 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 NLRX1Q86UT6 975 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 TMEM174Q8WUU8 243 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 RAPGEF5Q92565 580 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 NT5C1BQ96P26 610 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.72■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 ZBED4O75132 1171 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 EDN1P05305 212 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 PDE6CP51160 858 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 SMTNP53814 917 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 KRT76Q01546 638 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 MTMR3Q13615 1198 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 MTERF2Q49AM1 385 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 TMEM143Q96AN5 459 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 BICD1Q96G01 975 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 PWWP2AQ96N64 755 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 TSPYL1Q9H0U9 437 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 PARP14Q460N5 1801 aa16.71■□□□□ 0.27
NISCH-202ENST00000420808 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 TP73O15350 636 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 GZMAP12544 262 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PRKCEQ02156 737 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 IFT88Q13099 833 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 DLK2Q6UY11 383 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CCDC25Q86WR0 208 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PASD1Q8IV76 773 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 MTFR1LQ9H019 292 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CHST7Q9NS84 486 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ANKEF1Q9NU02 776 aa16.71■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 MICALL2Q8IY33 904 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 REPS2Q8NFH8 660 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 FBXL18Q96ME1 805 aa16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms