RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 FAM213AQ9BRX8 229 aa32.22■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 SKIP12755 728 aa32.21■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 ACOT2P49753 483 aa32.21■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 MYBPC2Q14324 1141 aa32.21■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM240Q5SV17 173 aa32.21■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 ECHDC2Q86YB7 292 aa32.21■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 GPD1LQ8N335 351 aa32.21■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa32.21■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP32.21■■■□□ 2.754e-8■■■■□ 21.2
ECHS1-201ENST00000368547 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa32.21■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 EXOC3O60645 756 aa32.2■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF623O75123 536 aa32.2■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 BAIAP3O94812 1187 aa32.2■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 LDHAP00338 332 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 TNFSF9P41273 254 aa32.2■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 FAM189BP81408 668 aa32.2■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP32.2■■■□□ 2.755e-10■■■■■ 26.9
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM192Q8IY95 271 aa32.2■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 APOL6Q9BWW8 343 aa32.2■■■□□ 2.75
ECHS1-201ENST00000368547 H0YGN5 161 aa32.19■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 EXTL3O43909 919 aa32.19■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 STAG3L1P0CL83 205 aa32.19■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 GRM5P41594 1212 aa32.19■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 PLCB2Q00722 1185 aa32.19■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CEP135Q66GS9 1140 aa32.19■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC55Q6ZSA7 311 aa32.19■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 SNTG2Q9NY99 539 aa32.19■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 TTC3P53804 2025 aa32.19■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CETN3O15182 167 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 EFCAB14O75071 495 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CASP4P49662 377 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 RDH13Q8NBN7 331 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 RNF169Q8NCN4 708 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 FBXL18Q96ME1 805 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 RNF39Q9H2S5 420 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 FANCLQ9NW38 375 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF18P17022 549 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 KYAT1Q16773 422 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 LPPQ93052 612 aa32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CITO14578 2027 aa32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 AKAP5P24588 427 aa32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 WDR5P61964 334 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CBWD2Q8IUF1 395 aa32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 HACE1Q8IYU2 909 aa32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM5Q9C035 493 aa32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1586Q9HCI6 787 aa32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CEP290O15078 2479 aa32.17■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 MEIS3P2A8K0S8 358 aa32.16■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 AKAP3O75969 853 aa32.16■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CLTAP09496 248 aa32.16■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ITGA4P13612 1032 aa32.16■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CEP63Q96MT8 703 aa32.16■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ACAP3Q96P50 834 aa32.16■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ZBBXA8MT70 800 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 EOMESO95936 686 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 PGBD4Q96DM1 585 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM161AQ9NX61 479 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 PARP2Q9UGN5 583 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF233A6NK53 670 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 RECQL4O94761 1208 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 KCNJ6P48051 423 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF75DP51815 510 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 AGMOQ6ZNB7 445 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 HERVK_113Q902F9 699 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa32.15■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 PTPRSQ13332 1948 aa32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 AMHP03971 560 aa32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ADRB2P07550 413 aa32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CXCL8P10145 99 aa32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB103AP81534 67 aa32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CRIPAKQ8N1N5 446 aa32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 LRFN2Q9ULH4 789 aa32.14■■■□□ 2.74
ECHS1-201ENST00000368547 ANK1P16157 1881 aa32.14■■■□□ 2.73
ECHS1-201ENST00000368547 TRIP11Q15643 1979 aa32.13■■■□□ 2.73
ECHS1-201ENST00000368547 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
ECHS1-201ENST00000368547 CDC25BP30305 580 aa32.13■■■□□ 2.73
ECHS1-201ENST00000368547 YARSP54577 528 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
ECHS1-201ENST00000368547 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
ECHS1-201ENST00000368547 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
ECHS1-201ENST00000368547 CDKAL1Q5VV42 579 aa32.13■■■□□ 2.73
ECHS1-201ENST00000368547 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa32.13■■■□□ 2.73
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