RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 ZPBP2Q6X784 338 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 HIPK3Q9H422 1215 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 NBNO60934 754 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 NPTXRO95502 500 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TCTN1Q2MV58 587 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 FAM26DQ5JW98 314 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 ALPK3Q96L96 1907 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 A0A1B0GUA9 196 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TEX33O43247 280 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 FAM189A1O60320 539 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM49P0CI25 452 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM49CP0CI26 452 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 CEP63Q96MT8 703 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 INTS13Q9NVM9 706 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 SELPP16109 830 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 GARTP22102 1010 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 SPAG1Q07617 926 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 MCL1Q07820 350 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 GPD1LQ8N335 351 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 FAM212AQ96EL1 285 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 BORCS6Q96GS4 357 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 APOL6Q9BWW8 343 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TRIP11Q15643 1979 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 NFIL3Q16649 462 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 UBXN11Q5T124 520 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 ABHD8Q96I13 439 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 RNF39Q9H2S5 420 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 PAK2Q13177 524 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 MIIPQ5JXC2 388 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 CAGE1Q8TC20 777 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TOX2Q96NM4 488 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 CLTBP09497 229 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 ABCD1P33897 745 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 BFSP2Q13515 415 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 SNTG2Q9NY99 539 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 TBX21Q9UL17 535 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 EXTL3O43909 919 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 AKAP5P24588 427 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 NOTUMQ6P988 496 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 FBXL18Q96ME1 805 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 ARID3AQ99856 593 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRT1-201ENST00000211413 OGTO15294 1046 aa20.2■□□□□ 0.82
PRRT1-201ENST00000211413 LRRN2O75325 713 aa20.2■□□□□ 0.82
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