RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 EFHC2Q5JST6 749 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SPECC1Q5M775 1068 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 ACER1Q8TDN7 264 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 MORC4Q8TE76 937 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 UBXN4Q92575 508 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 ASB7Q9H672 318 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 RSAD1Q9HA92 442 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 PFKPQ01813 784 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 PRKCQQ04759 706 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 H3BRJ5 948 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 OPLAHO14841 1288 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 OGTO15294 1046 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 H2AFZP0C0S5 128 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CDC25CP30307 473 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 PSEN1P49768 467 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 MORC3Q14149 939 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 USP41Q3LFD5 358 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 H2AFVQ71UI9 128 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 TRIM66O15016 1216 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 EXTL3O43909 919 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 ATG13O75143 517 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CASP7P55210 303 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 RHBDL3P58872 404 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CYP27A1Q02318 531 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CENPCQ03188 943 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 PGM5Q15124 567 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CASP10Q92851 521 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 GLMNQ92990 594 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 TLE6Q9H808 572 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 RAD18Q9NS91 495 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SQORQ9Y6N5 450 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SYCE3A1L190 88 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 PIK3CDO00329 1044 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 LGR5O75473 907 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CYP3A4P08684 503 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 PPP3CCP48454 512 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SPC24Q8NBT2 197 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 MID2Q9UJV3 735 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CTAGE9A4FU28 777 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 RASSF10A6NK89 507 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 OR6C75A6NL08 312 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 ARVCFO00192 962 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 MTSS1O43312 755 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 RALBP11234 206 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SDC4P31431 198 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 MTHFRP42898 656 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 SNAP25P60880 206 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 TYRO3Q06418 890 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CRHR2Q13324 411 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 DCAF6Q58WW2 860 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 CEP68Q76N32 757 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-212ENST00000591126 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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