RNA–Protein interactions for RNA: YKL095W

YJU2, Transcript of Essential protein required for pre-mRNA splicing, yeast

Gene YJU2, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJU2	YKL095W	YGL159W	P53110	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YGR067C	P53243	804 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	SUR7	P54003	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	MRS2	Q01926	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	TAF9	Q05027	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	PEX10	Q05568	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	PEX30	Q06169	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	MFG1	Q07684	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	CKA2	P19454	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	JEN1	P36035	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	MDV1	P47025	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YPS5	P53057	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	TPN1	P53099	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	ESA1	Q08649	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RSA1	Q08932	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	CBS2	P14905	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	MOB2	P43563	287 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	GMC1	Q04399	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	SEC10	Q06245	871 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	AYT1	Q12226	474 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJU2	YKL095W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	IFM1	P25038	676 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	FZO1	P38297	855 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	MET30	P39014	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	PEX22	P39718	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	POG1	P40473	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	HAC1	P41546	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	SCS3	P53012	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	TLG2	Q08144	397 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	HMS1	Q12398	434 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	MRS3	P10566	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YBR096W	P38256	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	PET8	P38921	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	BMT5	P40493	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	NCA3	P46955	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	AIM23	P47015	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	ALG13	P53178	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	RTC4	P53850	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	CTF19	Q02732	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	GAS2	Q06135	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	ICT1	Q12385	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	BNR1	P40450	1375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	CYC3	P06182	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	PMT2	P31382	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	KDX1	P36005	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	FES1	P38260	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	RCK1	P38622	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	RPR2	P40571	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YFR057W	P43625	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	NUP57	P48837	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YIP3	P53633	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	SWS2	P53937	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	FAR10	Q06001	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YET3	Q07451	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	HEM25	Q07534	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	MHP1	P43638	1398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	TRP1	P00912	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	EHD3	P28817	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	VPH2	P32341	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	AEP1	P32493	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	YKL075C	P36083	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJU2	YKL095W	CHL4	P38907	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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