RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 NR3C1P04150 777 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 NUDT17P0C025 328 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 RSPH10BP0C881 870 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 LMNB1P20700 586 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 KCNA3P22001 575 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 CA4P22748 312 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 PEX5P50542 639 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 PICALMQ13492 652 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 CUL3Q13618 768 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 PPP2R5EQ16537 467 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 SGO2Q562F6 1265 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 DCAF12L1Q5VU92 463 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 PALB2Q86YC2 1186 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 C5P01031 1676 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 DISP2A7MBM2 1401 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 A0A0G2JND7 137 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 USP17L15C9J2P7 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 USP17L11C9JVI0 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 USP17L18D6R9N7 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 USP17L22D6RA61 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 USP17L19D6RCP7 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 USP17L20D6RJB6 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 PODXLO00592 558 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 CLDN3O15551 220 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 MAP3K13O43283 966 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 AHCYL1O43865 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 PHF2O75151 1096 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 UNC5CO95185 931 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 COMTP21964 271 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 YY1P25490 414 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 CHRNA3P32297 505 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 ZNF76P36508 570 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 USP17L24Q0WX57 530 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 OVGP1Q12889 678 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 STRN3Q13033 797 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 RCN1Q15293 331 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 PRR16Q569H4 304 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 MYCT1Q8N699 235 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 PRELID2Q8N945 189 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 FAM13CQ8NE31 585 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 ZNF384Q8TF68 577 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 STK32AQ8WU08 396 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 CNKSR1Q969H4 720 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 HES6Q96HZ4 224 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-235ENST00000616247 ABCB11O95342 1321 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 FAM196BA6NMK8 535 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 PIAS1O75925 651 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 SKIP12755 728 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 RARGP13631 454 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 KRT17Q04695 432 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 MPP2Q14168 576 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 TTC27Q6P3X3 843 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 ZNF365Q70YC5 407 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 TEX9Q8N6V9 391 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 MXD3Q9BW11 206 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 CARD9Q9H257 536 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 VPS37BQ9H9H4 285 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 NPHS2Q9NP85 383 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 SLAIN2Q9P270 581 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 DNM3Q9UQ16 869 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 TMEM94Q12767 1356 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 CES2O00748 559 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 ATP9AO75110 1047 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 FAM13AO94988 1023 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 BAG3O95817 575 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 PYGMP11217 842 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 CNGA1P29973 690 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 CHKAP35790 457 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-235ENST00000616247 CPA2P48052 419 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms