RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.15■□□□□ 0.18
TSTA3-208ENST00000528920 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC169A6NNP5 214 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 SFI1A8K8P3 1242 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 EOMESO95936 686 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 SKIP12755 728 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 PLS3P13797 630 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 RAB27AP51159 221 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 GIT2Q14161 759 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 MAPK6Q16659 721 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 UBXN11Q5T124 520 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 RESP18Q5W5W9 173 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 NOTUMQ6P988 496 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 SV2BQ7L1I2 683 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 PDILTQ8N807 584 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC51Q96ER9 411 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 KMT5AQ9NQR1 393 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ACKR2O00590 384 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 B4GALT5O43286 388 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF623O75123 536 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 PRKCBP05771 671 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 IGFBP4P22692 258 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 GATMP50440 423 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF131P52739 623 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 E2F4Q16254 413 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ADALQ6DHV7 355 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 FIBCD1Q8N539 461 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CPB2Q96IY4 423 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 RNF19AQ9NV58 838 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.13■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CHD9Q3L8U1 2897 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1B0GUA9 196 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 MYMKA6NI61 221 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 K7ERI5 159 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 SLC16A4O15374 487 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 HOXA2O43364 376 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 FAM13AO94988 1023 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 FGFR1P11362 822 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 SMTNP53814 917 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ERVK-21P61565 698 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ADGRE1Q14246 886 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 SPRED2Q7Z698 418 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 IQUBQ8NA54 791 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 RNF169Q8NCN4 708 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CUEDC2Q9H467 287 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM134Q9H6X4 195 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa16.12■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 TNFRSF10AO00220 468 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 EDN1P05305 212 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 LIG1P18858 919 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CMA1P23946 247 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 DYMQ7RTS9 669 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 DDX12PQ92771 950 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 DHX58Q96C10 678 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 SAMD11Q96NU1 681 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CERS4Q9HA82 394 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 PARVGQ9HBI0 331 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 THEGQ9P2T0 379 aa16.11■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.1■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 N4BP3O15049 544 aa16.1■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00271P0C7V0 271 aa16.1■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 NCKAP1LP55160 1127 aa16.1■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.1■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 NT5DC1Q5TFE4 455 aa16.1■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 TAS1R3Q7RTX0 852 aa16.1■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 ABI1Q8IZP0 508 aa16.1■□□□□ 0.17
TSTA3-208ENST00000528920 MYCT1Q8N699 235 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms