RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MIIPQ5JXC2 388 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MFSD5Q6N075 450 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFPM1Q8IX07 1006 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHAC2Q8WUX2 184 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 RSAD2Q8WXG1 361 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR87Q9BY21 358 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PARPBPQ9NWS1 579 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRSS50Q9UI38 385 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 NRP1O14786 923 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTSS1O43312 755 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 GNAT2P19087 354 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASRP41180 1078 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAN2A2P49641 1150 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCNN1GP51170 649 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 LGALS4P56470 323 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SESN3P58005 492 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 UGT8Q16880 541 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q6ZRM9 215 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMPRSS6Q8IU80 811 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MB21D1Q8N884 522 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PGBD4Q96DM1 585 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRAMEF4O60810 478 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 STC2O76061 302 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 IPO13O94829 963 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF202O95125 648 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNGA1P29973 690 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACVRL1P37023 503 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDCD1Q15116 288 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBE3CQ15386 1083 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 ST8SIA2Q92186 375 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PR48 441 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYR61O00622 381 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 BRINP1O60477 761 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPEP16870 476 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 HK1P19367 917 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUSP2Q05923 314 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 TUBA3CQ13748 450 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 TUBA3EQ6PEY2 450 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 MNTQ99583 582 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 EDARQ9UNE0 448 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 HDAC5Q9UQL6 1122 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 XDHP47989 1333 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CFBP00751 764 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 MCM7P33993 719 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCAND1P57086 179 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMPRSS15P98073 1019 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDK17Q00537 523 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABHD18Q0P651 414 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL17RAQ96F46 866 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACAP3Q96P50 834 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRIQ9BWK5 157 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEP72Q9P209 647 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 DPP7Q9UHL4 492 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.2 ms