RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SCLT1Q96NL6 688 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 FANCLQ9NW38 375 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ARVCFO00192 962 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PSMA7O14818 248 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 B4GALT5O43286 388 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CCNE1P24864 410 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SYCP1Q15431 976 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CENPPQ6IPU0 288 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TTI2Q6NXR4 508 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 IFNKQ9P0W0 207 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 K7ERI5 159 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 STIM1Q13586 685 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SERINC5Q86VE9 423 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SESTD1Q86VW0 696 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 NOD1Q9Y239 953 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PPP2R5AQ15172 486 aa20.39■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.39■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.39■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.39■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD7Q92527 254 aa20.39■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.39■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 DACH1Q9UI36 760 aa20.39■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ATP1A3P13637 1013 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 THPOP40225 353 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CDK7P50613 346 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 PTENP60484 403 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CEP135Q66GS9 1140 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 MYL5Q02045 173 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ACCSQ96QU6 501 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CHRNA1P02708 482 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 KCNJ6P48051 423 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 FANCCQ00597 558 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 BICD1Q96G01 975 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CPB2Q96IY4 423 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 SIP14410 1827 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 USP27XA6NNY8 438 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ASAP2O43150 1006 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 PRKCBP05771 671 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TFDP1Q14186 410 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 PTPN14Q15678 1187 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 COL6A1P12109 1028 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ADSSP30520 456 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CASP4P49662 377 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CYP2J2P51589 502 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM60Q495X7 471 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 SEZ6Q53EL9 994 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA1Q5VX52 437 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 TMC6Q7Z403 805 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 RDH13Q8NBN7 331 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT1-201ENST00000211413 GBP3Q9H0R5 595 aa20.36■□□□□ 0.85
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