RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 VSIG1Q86XK7 387 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 THAP9Q9H5L6 903 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.33□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TJP1Q07157 1748 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GSTT2P0CG29 244 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GSTT2BP0CG30 244 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF844Q08AG5 666 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 NEPROQ6NW34 567 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 STMN2Q93045 179 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 VPS50Q96JG6 964 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MYL10Q9BUA6 226 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 H0Y3Z8 333 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SNX3O60493 162 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RAD17O75943 681 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM153BP0C7A2 387 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PHBP35232 272 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MCAMP43121 646 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 BCL2A1Q16548 175 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 AOC3Q16853 763 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM153CQ494X1 144 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC51AQ86UW1 340 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GATA6Q92908 595 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 OPHN1O60890 802 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 LYNP07948 512 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CHN1P15882 459 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GALK1P51570 392 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 UNC13DQ70J99 1090 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ASRGL1Q7L266 308 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 NELFBQ8WX92 580 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 INPP5DQ92835 1189 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 HACL1Q9UJ83 578 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SMIM23A6NLE4 172 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ADCY3O60266 1144 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 STAM2O75886 525 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PDE8BO95263 885 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PLS1Q14651 629 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FXNQ16595 210 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TTC30AQ86WT1 665 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TRPC4APQ8TEL6 797 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ALG1Q9BT22 464 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ARMT1Q9H993 441 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 HPSEQ9Y251 543 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC169A6NNP5 214 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 BBOX1O75936 387 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CCNB1P14635 433 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 COG7P83436 770 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.081e-6■■■□□ 17.1
EFTUD2-218ENST00000590367 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TAOK1Q7L7X3 1001 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PHKBQ93100 1093 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 DYDC2Q96IM9 177 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.6 ms