RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	PTEN	P60484	403 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	DPF3	Q92784	378 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCD4-223	ENST00000555904	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	UBE4B	O95155	1302 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	CHRNA1	P02708	482 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	PPP1R2	P41236	205 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	BICD1	Q96G01	975 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR182	O15218	404 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	TIMP1	P01033	207 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	PRKCB	P05771	671 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	RFC2	P35250	354 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	EHHADH	Q08426	723 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	MGAT3	Q09327	533 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	PAK2	Q13177	524 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	TBX20	Q9UMR3	447 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	MYB	P10242	640 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	GHR	P10912	638 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	CYP2C18	P33260	490 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	CCL23	P55773	120 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	GTF2B	Q00403	316 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	STK4	Q13043	487 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	MORC3	Q14149	939 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	STX1A	Q16623	288 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	SYCE3	A1L190	88 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	ACKR2	O00590	384 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	PSMA7	O14818	248 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	LIG4	P49917	911 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	CASP5	P51878	434 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	LPIN1	Q14693	890 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	MLKL	Q8NB16	471 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-223	ENST00000555904	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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