RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC169A6NNP5 214 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 SFI1A8K8P3 1242 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 GJB5O95377 273 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 LIG1P18858 919 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PEX3P56589 373 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 POU5F1BQ06416 359 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 DSC3Q14574 896 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 TOP1MTQ969P6 601 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 DHX58Q96C10 678 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 RGS18Q9NS28 235 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.87■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 SV2BQ7L1I2 683 aa21.87■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 TIFAQ96CG3 184 aa21.87■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.87■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.87■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.87■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 TSPAN1O60635 241 aa21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 NPTX2P47972 431 aa21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 YME1L1Q96TA2 773 aa21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 SZT2Q5T011 3432 aa21.86■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 TTC3P53804 2025 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 C9IYK1 514 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 B4GALT5O43286 388 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 FAM13AO94988 1023 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 CA3P07451 260 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PLS3P13797 630 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 E2F4Q16254 413 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 ADALQ6DHV7 355 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 DYMQ7RTS9 669 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 IQUBQ8NA54 791 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 CPB2Q96IY4 423 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 CHST12Q9NRB3 414 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 DACT1Q9NYF0 836 aa21.85■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 A0A1B0GVL5 298 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 LCHNA4D1U4 455 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PRKCBP05771 671 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 STAG3L1P0CL83 205 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PFKFB1P16118 471 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 GIT2Q14161 759 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 MAPK6Q16659 721 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 AMHR2Q16671 573 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 RNF169Q8NCN4 708 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 STAMQ92783 540 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 RAD9AQ99638 391 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.84■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 MYMKA6NI61 221 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 SLC16A4O15374 487 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 CMA1P23946 247 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 MYCT1Q8N699 235 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 DDX12PQ92771 950 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 CUEDC2Q9H467 287 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PARVGQ9HBI0 331 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 INSL6Q9Y581 213 aa21.83■■□□□ 1.09
HLA-B-255ENST00000498007 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 COL4A6Q14031 1691 aa21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 GATMP50440 423 aa21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 EFNA5P52803 228 aa21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 SMTNP53814 917 aa21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 NOTUMQ6P988 496 aa21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 FSIP1Q8NA03 581 aa21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.82■■□□□ 1.08
HLA-B-255ENST00000498007 FAM161BQ96MY7 647 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 212.9 ms