RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa26.93■■□□□ 1.9
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ECHDC3-201ENST00000379215 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.9■■□□□ 1.9
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ECHDC3-201ENST00000379215 CEP135Q66GS9 1140 aa26.89■■□□□ 1.9
ECHDC3-201ENST00000379215 ARMCX5Q6P1M9 558 aa26.89■■□□□ 1.9
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ECHDC3-201ENST00000379215 PHKA2P46019 1235 aa26.87■■□□□ 1.89
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ECHDC3-201ENST00000379215 MARCH8Q5T0T0 291 aa26.87■■□□□ 1.89
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ECHDC3-201ENST00000379215 NLRP4Q96MN2 994 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHDC3-201ENST00000379215 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
ECHDC3-201ENST00000379215 WBP1LQ9NX94 342 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHDC3-201ENST00000379215 HSPBP1Q9NZL4 362 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHDC3-201ENST00000379215 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
ECHDC3-201ENST00000379215 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa26.85■■□□□ 1.89
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