RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 SLC15A2Q16348 729 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 RNF43Q68DV7 783 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ZNF365Q70YC5 407 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SFR1Q86XK3 245 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PARVGQ9HBI0 331 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CACNA1SQ13698 1873 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 E9PMD0 336 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SLC37A4O43826 429 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ANP32DO95626 131 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ATF2P15336 505 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PCK1P35558 622 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 FMO5P49326 533 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 JAM2P57087 298 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PARP6Q2NL67 630 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CCDC89Q8N998 374 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 COA7Q96BR5 231 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 MAGEB18Q96M61 343 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 AGPAT1Q99943 283 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TMEM260Q9NX78 707 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SMIM23A6NLE4 172 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 USP17L5A8MUK1 530 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ECHS1P30084 290 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ACVR2BQ13705 512 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SLC29A2Q14542 456 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TAF11Q15544 211 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CCDC6Q16204 474 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CCDC25Q86WR0 208 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 MYCT1Q8N699 235 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 INPP5DQ92835 1189 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SNF8Q96H20 258 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 AMNQ9BXJ7 453 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 POTEB3A0JP26 581 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 POTECB2RU33 542 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 EXOC3O60645 756 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TCEA3O75764 348 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ABCB4P21439 1286 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CTNNA2P26232 953 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ABCD1P33897 745 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SLC1A1P43005 524 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 MSH2P43246 934 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 NOVP48745 357 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PSEN1P49768 467 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 MFAP3P55082 362 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GRAPQ13588 217 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SPARCL1Q14515 664 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 QPCTQ16769 361 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 Q4G0T1 1027 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CMPK2Q5EBM0 449 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 POTEBQ6S5H4 581 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 BARGINQ6ZT62 677 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CNKSR1Q969H4 720 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 NACC1Q96RE7 527 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 STOML1Q9UBI4 398 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 NARFQ9UHQ1 456 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 A0A1B0GUL6 1792 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 RIPK2O43353 540 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 MTA2O94776 668 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ZWINTO95229 277 aa6.93□□□□□ -1.3
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