RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 NELFBQ8WX92 580 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 EDN1P05305 212 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 GSDMDP57764 484 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 PSMD2Q13200 908 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 MLKLQ8NB16 471 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 RETREG2Q8NC44 543 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 KCND1Q9NSA2 647 aa20.47■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 MAGEB2O15479 319 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 HOXC8P31273 242 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 KIZQ2M2Z5 673 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 IFT74Q96LB3 600 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 TIPINQ9BVW5 301 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 PHF24Q9UPV7 400 aa20.46■□□□□ 0.87
PRRT1-201ENST00000211413 A0A087WZ62 844 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 DENND3A2RUS2 1198 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 DNM1LO00429 736 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 IKBKBO14920 756 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TNNT1P13805 278 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 FGFR4P22455 802 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 NCKAP1LP55160 1127 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TPM4P67936 248 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 NCAPHQ15003 741 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 DNM2P50570 870 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CCZ1BP86790 482 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ARID5BQ14865 1188 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PTGISQ16647 500 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 STRA6Q9BX79 667 aa20.45■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PPP1R37O75864 691 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 IQCF3P0C7M6 154 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SKILP12757 684 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TCP11Q8WWU5 503 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.44■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CLIC2O15247 247 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 B4GALT4O60513 344 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 DEPTORQ8TB45 409 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TSC1Q92574 1164 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PPME1Q9Y570 386 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CTSHP09668 335 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TMOD1P28289 359 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 NAMPTP43490 491 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 GJA8P48165 433 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 PAK1Q13153 545 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP7Q8WX94 980 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.43■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TGFB1I1O43294 461 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CABYRO75952 493 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 GPC3P51654 580 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SMTNP53814 917 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 RTP1P59025 263 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 P2RX5Q93086 422 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 OSMRQ99650 979 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 TBX20Q9UMR3 447 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 GPR32O75388 356 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 GNAT1P11488 350 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT1-201ENST00000211413 GTF2BQ00403 316 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms