RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622815.1

DUXAP9-208, Transcript of double homeobox A pseudogene 9, human

BASIC

Gene DUXAP9, Length 614 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DUXAP9-208	ENST00000622815	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	DAPK3	O43293	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	NR4A1	P22736	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	RASA3	Q14644	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	APOL3	O95236	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ABHD16A	O95870	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ADRA1B	P35368	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	FNTB	P49356	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	NPEPPS	P55786	919 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	PTPA	Q15257	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	NPTXR	O95502	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	GNAT2	P19087	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	LENG9	Q96B70	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ITGB1	P05556	798 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	SPIDR	Q14159	915 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815		H7C1D1	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	SLC9A1	P19634	815 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	SERINC3	Q13530	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZNF174	Q15697	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DUXAP9-208	ENST00000622815	CFB	P00751	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUXAP9-208	ENST00000622815	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms