RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FEZF2Q8TBJ5 459 aa18.77■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RSAD2Q8WXG1 361 aa18.77■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.77■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.77■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 E7EWF7 191 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHA8P1O95397 391 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GALTP07902 379 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SKIP12755 728 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP4AP20648 1035 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLCN3P51790 818 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMNB2Q03252 620 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NIPA1Q7RTP0 329 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR152Q8TDT2 470 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYL10Q9BUA6 226 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHST12Q9NRB3 414 aa18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CALM1P0DP23 149 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CALM2P0DP24 149 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CALM3P0DP25 149 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF76P36508 570 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMTC2Q8N394 836 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PJA1Q8NG27 643 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHDQ96IW2 340 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCLT1Q96NL6 688 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTA3Q9BTC8 594 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LY9Q9HBG7 655 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO4Q9UKT5 387 aa18.75■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLUHO75153 1309 aa18.74■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FANCMQ8IYD8 2048 aa18.74■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EVPLQ92817 2033 aa18.74■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANTXR2P58335 489 aa18.74■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOMO2Q5JPE7 1267 aa18.74■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.74■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM167AQ96KS9 214 aa18.74■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTKNQ9BST9 563 aa18.74■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa18.74■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.74■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHKA2P46019 1235 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPC3P51654 580 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASC1Q6TDU7 716 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NFXL1Q6ZNB6 911 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANO3Q9BYT9 981 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL25Q9H293 177 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIC8AQ9NPQ8 531 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAN1C1Q9NR34 630 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa18.73■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC69A6NI79 296 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAMTOR5O43504 91 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LILRB3O75022 631 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADH1AP07327 375 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSAPP07602 524 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SREBF1P36956 1147 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STARD6P59095 220 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC42EP1Q00587 391 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP7Q8WX94 980 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATRIPQ8WXE1 791 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYADMQ96S97 322 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VN1R3Q9BXE9 311 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCO2Q9BYV7 579 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D22BQ9NU19 505 aa18.72■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.71■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POTEMA6NI47 508 aa18.71■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INPPL1O15357 1258 aa18.71■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC11A1P49279 550 aa18.71■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AP3B2Q13367 1082 aa18.71■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.71■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R18Q6NYC8 613 aa18.71■□□□□ 0.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POTEGQ6S5H5 508 aa18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms