RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.65■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 CYP4F11Q9HBI6 524 aa16.65■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
KCNS1-201ENST00000306117 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SARSP49591 514 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KCNH2Q12809 1159 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RAPH1Q70E73 1250 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SLC26A7Q8TE54 656 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 WNT7AO00755 349 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KITP10721 976 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KLRK1P26718 216 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ARFIP2P53365 341 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CENPUQ71F23 418 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CRLF3Q8IUI8 442 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 OLFM3Q96PB7 478 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SORBS3O60504 671 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KCNA3P22001 575 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ECE1P42892 770 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PKN1Q16512 942 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 HDAC11Q96DB2 347 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 BARHL2Q9NY43 387 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 BAG5Q9UL15 447 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SUPT3HO75486 399 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 AP2B1P63010 937 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 COASYQ13057 564 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RASSF3Q86WH2 238 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RFX6Q8HWS3 928 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CPP00450 1065 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KRT1P04264 644 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CCND1P24385 295 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CACNB3P54284 484 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PTGISQ16647 500 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 AOC3Q16853 763 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SERPINI1Q99574 410 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CALN1Q9BXU9 219 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SH2D4AQ9H788 454 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ARHGAP10A1A4S6 786 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MYMKA6NI61 221 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 POTEFA5A3E0 1075 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 POTEIP0CG38 1075 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 FGFR4P22455 802 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 POTEGQ6S5H5 508 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 DONSONQ9NYP3 566 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CEP72Q9P209 647 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.63■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MEGF6O75095 1541 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KRT3P12035 628 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KRT10P13645 584 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 XKR9Q5GH70 373 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM139Q8IV31 216 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RHOBTB3O94955 611 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KLRC1P26715 233 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 GARSP41250 739 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CASP2P42575 452 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ATG16L1Q676U5 607 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TEKT4Q8WW24 435 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CNGA1P29973 690 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 LIG4P49917 911 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC125Q86Z20 511 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 NUDCD3Q8IVD9 361 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 COPEO14579 308 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ANO5Q75V66 913 aa16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms