RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 POMGNT1Q8WZA1 660 aa18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 ATP6V0A1Q93050 837 aa18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 ERGIC2Q96RQ1 377 aa18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 DISP2A7MBM2 1401 aa18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 TM4SF1P30408 202 aa18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 MTMR1Q13613 665 aa18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.39■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 SPDL1Q96EA4 605 aa18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 SAAL1Q96ER3 474 aa18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.39■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 PMS2P54278 862 aa18.38■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 SGO2Q562F6 1265 aa18.38■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 PARVGQ9HBI0 331 aa18.38■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.37■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.37■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 ZNF449Q6P9G9 518 aa18.37■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.37■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 A0A087X0B3 334 aa18.36■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 GOLPH3Q9H4A6 298 aa18.36■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.36■□□□□ 0.53
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TRPC1-201ENST00000273482 CYB5D1Q6P9G0 228 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 KCNV2Q8TDN2 545 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 FAM20AQ96MK3 541 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R16BQ96T49 567 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 C7orf25Q9BPX7 421 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 PITPNM3Q9BZ71 974 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPC1-201ENST00000273482 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
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