RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM151AQ8WW52 585 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNB2Q92953 911 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 PHKA2P46019 1235 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 TTLL4Q14679 1199 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 COG2Q14746 738 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT39Q6A163 491 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA24Q86W54 205 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ARMCX2Q7L311 632 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 CDO1Q16878 200 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 LPAR1Q92633 364 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP3K14Q99558 947 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 VCPKMTQ9H867 229 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 PCK1P35558 622 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 GRIN1Q05586 938 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF6Q15052 776 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.23■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 PDXKO00764 312 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 PSMD6Q15008 389 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF699Q32M78 642 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF18P17022 549 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMA2P25787 234 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 EMBQ6PCB8 327 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 EMSYQ7Z589 1322 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1B0GTH6 734 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 MYMKA6NI61 221 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZWILCHQ9H900 591 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 PXDNQ92626 1479 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMD14O00487 310 aa22.22■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 SCYL1Q96KG9 808 aa22.22■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 TBK1Q9UHD2 729 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.22■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 IL9RQ01113 521 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 MROH2AA6NES4 1674 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 GYS1P13807 737 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 PRPSAP1Q14558 356 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 BBS9Q3SYG4 887 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA33Q96N06 139 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 TBX3O15119 743 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 CPP00450 1065 aa22.21■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 ARPP19P56211 112 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 SNX24Q9Y343 169 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRJ-208ENST00000615445 NCK2O43639 380 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 CHP1Q99653 195 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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