RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 H2AFVQ71UI9 128 aa28.21■■■□□ 2.11
OPN3-204ENST00000469376 SYCE1Q8N0S2 351 aa28.21■■■□□ 2.11
OPN3-204ENST00000469376 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.21■■■□□ 2.11
OPN3-204ENST00000469376 ESYT3A0FGR9 886 aa28.2■■■□□ 2.11
OPN3-204ENST00000469376 SNAP25P60880 206 aa28.2■■■□□ 2.11
OPN3-204ENST00000469376 CYP4A11Q02928 519 aa28.2■■■□□ 2.11
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OPN3-204ENST00000469376 BORCS6Q96GS4 357 aa28.2■■■□□ 2.11
OPN3-204ENST00000469376 UBE4BO95155 1302 aa28.2■■■□□ 2.11
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OPN3-204ENST00000469376 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa28.2■■■□□ 2.1
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OPN3-204ENST00000469376 FAM13AO94988 1023 aa28.19■■■□□ 2.1
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OPN3-204ENST00000469376 PIK3R5Q8WYR1 880 aa28.19■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
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OPN3-204ENST00000469376 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 FMNL3Q8IVF7 1028 aa28.19■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 KLHL7Q8IXQ5 586 aa28.19■■■□□ 2.1
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OPN3-204ENST00000469376 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa28.19■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.18■■■□□ 2.1
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OPN3-204ENST00000469376 MUTP22033 750 aa28.18■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 EFCAB13Q8IY85 973 aa28.18■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 BCAS4Q8TDM0 211 aa28.18■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 HSD17B14Q9BPX1 270 aa28.18■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 SEL1LQ9UBV2 794 aa28.18■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa28.18■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 EBAG9O00559 213 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 GDF11O95390 407 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 GUCY2FP51841 1108 aa28.17■■■□□ 2.1
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OPN3-204ENST00000469376 PEX26Q7Z412 305 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 FAM186BQ8IYM0 893 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 RASGEF1CQ8N431 466 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 CLIC2O15247 247 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 PPM1EQ8WY54 764 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 RGL1Q9NZL6 768 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.11e-10■■■■□ 22.5
OPN3-204ENST00000469376 KRT14P02533 472 aa28.16■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa28.16■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 C1orf186Q6ZWK4 172 aa28.16■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.16■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 METTL13Q8N6R0 699 aa28.16■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 CCT5P48643 541 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 PPP2R5CQ13362 524 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 ERVK-9P63128 1117 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 OTOP1Q7RTM1 612 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 MYCT1Q8N699 235 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 LRRC45Q96CN5 670 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 STK33Q9BYT3 514 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 PARVGQ9HBI0 331 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 PRR12Q9ULL5 1215 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 NCANO14594 1321 aa28.14■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 ZEB2O60315 1214 aa28.14■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 SOX5P35711 763 aa28.14■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 KCNA1Q09470 495 aa28.14■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 SLC30A5Q8TAD4 765 aa28.14■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa28.14■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa28.14■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 GGA3Q9NZ52 723 aa28.14■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 KCND2Q9NZV8 630 aa28.14■■■□□ 2.1
OPN3-204ENST00000469376 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TMCO5BA8MYB1 307 aa28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 PSMD10O75832 226 aa28.13■■■□□ 2.09
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