RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 HAUS7Q99871 368 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 NDST4Q9H3R1 872 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CDH3P22223 829 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 STAT4Q14765 748 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 LAMA4Q16363 1823 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 GPAA1O43292 621 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 DAPK3O43293 454 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CNBD2Q96M20 576 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PARVGQ9HBI0 331 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.9□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 BIRC5O15392 142 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PAX3P23760 479 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PEX5P50542 639 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MYOM1P52179 1685 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 F8VZ95 297 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RASSF9O75901 435 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 POTEIP0CG38 1075 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CDC25CP30307 473 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 C21orf59P57076 290 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PTPROQ16827 1216 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CCT6BQ92526 530 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MS4A14Q96JA4 679 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 S100A5P33763 92 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RGS21Q2M5E4 152 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC103Q8IW40 242 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PROM2Q8N271 834 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 DACH2Q96NX9 599 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CASZ1Q86V15 1759 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MYBL1P10243 752 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 KRT39Q6A163 491 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CABP7Q86V35 215 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 HIPK4Q8NE63 616 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 KAT2BQ92831 832 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 POLE3Q9NRF9 147 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 WDR91A4D1P6 747 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 DPPA5A6NC42 116 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 GALNT17Q6IS24 598 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 CNKSR1Q969H4 720 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 OMA1Q96E52 524 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 THTPAQ9BU02 230 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PREX2Q70Z35 1606 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1W2PQJ5 194 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 EXOC3O60645 756 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PSMC3P17980 439 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SPATA5Q8NB90 893 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 EME1Q96AY2 570 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 SNRKQ9NRH2 765 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 HAO1Q9UJM8 370 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 FAM25AB3EWG3 89 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 FAM25CB3EWG5 89 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 FAM25GB3EWG6 89 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TSPY3P0CV98 308 aa6.89□□□□□ -1.31
SBNO1-202ENST00000420886 TSPY8P0CW00 308 aa6.89□□□□□ -1.31
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