RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NISCH-212ENST00000488380 ZNF543Q08ER8 600 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-212ENST00000488380 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-212ENST00000488380 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-212ENST00000488380 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-212ENST00000488380 HAS1Q92839 578 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-212ENST00000488380 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-212ENST00000488380 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NISCH-212ENST00000488380 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.65□□□□□ -0.06
NISCH-212ENST00000488380 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NISCH-212ENST00000488380 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 FAM170AA1A519 330 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CENPPQ6IPU0 288 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 DDX12PQ92771 950 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 LTBP1Q14766 1721 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TTI1O43156 1089 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ITGA4P13612 1032 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ADRA2BP18089 450 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 AMPD3Q01432 767 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 HGSNATQ68CP4 663 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SLF2Q8IX21 1173 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.64□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP17L15C9J2P7 530 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP17L11C9JVI0 530 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP17L18D6R9N7 530 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP17L22D6RA61 530 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP17L19D6RCP7 530 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP17L20D6RJB6 530 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TTLL1O95922 423 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SERPING1P05155 500 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SMARCA1P28370 1054 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SNAP25P60880 206 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP17L24Q0WX57 530 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 RAD54LQ92698 747 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ZNF570Q96NI8 536 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 MYBL1P10243 752 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TCP10Q12799 353 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 AFF2P51816 1311 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PAEPP09466 180 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 UNC13DQ70J99 1090 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 KLHL29Q96CT2 875 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 DNAJC18Q9H819 358 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.63□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 DAAM2Q86T65 1068 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 F8VZ95 297 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 TLR2O60603 784 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 UBOX5O94941 541 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 EPS15P42566 896 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 SLC18A3Q16572 532 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.62□□□□□ -0.07
NISCH-212ENST00000488380 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms