RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 GDF3Q9NR23 364 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-202ENST00000420808 COL4A5P29400 1685 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-202ENST00000420808 CNTNAP1P78357 1384 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA6CA6NDK9 693 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 GAS7O60861 476 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA6DP0CG33 693 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 GLYCTKQ8IVS8 523 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 USP38Q8NB14 1042 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 IL31RAQ8NI17 732 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 AGBL1Q96MI9 1066 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 OLFML3Q9NRN5 406 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 COL20A1Q9P218 1284 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 TMX2Q9Y320 296 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 TULP2O00295 520 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 EVI5O60447 810 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 KIF4AO95239 1232 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 POLR2MP0CAP2 368 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 SPDYE6P0CI01 402 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ITGA4P13612 1032 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 DAW1Q8N136 415 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 SLC5A5Q92911 643 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 GPR88Q9GZN0 384 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 TAS2R14Q9NYV8 317 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 RSPH14Q9UHP6 348 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 NENFQ9UMX5 172 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 PCNTO95613 3336 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 CEP104O60308 925 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 DLG4P78352 724 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 GRIPAP1Q4V328 841 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 METTL13Q8N6R0 699 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 TPCN2Q8NHX9 752 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 PIK3R5Q8WYR1 880 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ZNF577Q9BSK1 485 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 PARVGQ9HBI0 331 aa17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 SHTN1A0MZ66 631 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 PRELPP51888 382 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 RPS6KA1Q15418 735 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 CEP55Q53EZ4 464 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 STYK1Q6J9G0 422 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ZNF720Q7Z2F6 126 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 LXNQ9BS40 222 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 PCIF1Q9H4Z3 704 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 MYH11P35749 1972 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 KIF13BQ9NQT8 1826 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 PLSCR1O15162 318 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 SLC26A4O43511 780 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ITGB5P18084 799 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ABCB4P21439 1286 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 PPP2R5CQ13362 524 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ODR4Q5SWX8 454 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ELMO3Q96BJ8 720 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 SH3GL2Q99962 352 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 TSKSQ9UJT2 592 aa17■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 PRKCIP41743 596 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 FMO5P49326 533 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ERVK-9P63128 1117 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 MAPK7Q13164 816 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ARHGAP44Q17R89 818 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 LDHDQ86WU2 507 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 FAM76AQ8TAV0 307 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 NR2E1Q9Y466 385 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ZNF233A6NK53 670 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 NFIBO00712 420 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 INPP5BP32019 993 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 COPB2P35606 906 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 GALCP54803 685 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 CAVIN3Q969G5 261 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 HOOK2Q96ED9 719 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.99■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 F8VZ95 297 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 HIP1RO75146 1068 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 ECHS1P30084 290 aa16.98■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
NISCH-202ENST00000420808 NAA35Q5VZE5 725 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.9 ms