RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNNT1P13805 278 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCL15Q16663 113 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MORC4Q8TE76 937 aa24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BTBD19C9JJ37 291 aa24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP2C8P10632 490 aa24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPEPPSP55786 919 aa24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEDD9Q14511 834 aa24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP26C1Q6V0L0 522 aa24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLXNB2O15031 1838 aa24.05■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBB4AP04350 444 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLK7P49862 253 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNA1P78396 465 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBED6P86452 979 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKCEQ02156 737 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GBP3Q9H0R5 595 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.04■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 K7ENM7 598 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PGK2P07205 417 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYBPC2Q14324 1141 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XKR3Q5GH77 459 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPRYD7Q5W111 196 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 REXO1L1PQ8IX06 675 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP170P1Q96L14 293 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCM3APO60318 1980 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKAP3O75969 853 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCKAP1LP55160 1127 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SP4Q02446 784 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEA1Q16626 185 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH2D3AQ9BRG2 576 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM206Q9H813 350 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.03■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DGAT1O75907 488 aa24.02■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF2BQ00403 316 aa24.02■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.02■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIFAP3Q92845 792 aa24.02■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PORCNQ9H237 461 aa24.02■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.02■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.02■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DMAC2Q9NW81 257 aa24.02■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTF1Q14872 753 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 METTL7BQ6UX53 244 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF302Q9NR11 478 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLIC2O15247 247 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC175P0C221 793 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTP1P59025 263 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HVCN1Q96D96 273 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BORCS6Q96GS4 357 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFCC1Q9HA90 598 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.01■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK17Q00537 523 aa24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNMA1Q12791 1236 aa24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNH2Q12809 1159 aa24■■□□□ 1.43
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms