RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP11AP98196 1134 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 USP49Q70CQ1 688 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 CLDN3O15551 220 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 ECEL1O95672 775 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 KSR1Q8IVT5 923 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM9Q9C026 710 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 HSPA6P17066 643 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 CALN1Q9BXU9 219 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT1P04264 644 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP55Q53EZ4 464 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 CERKQ8TCT0 537 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 NBPF3Q9H094 633 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 MED7O43513 233 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 RILPQ96NA2 401 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 DENND3A2RUS2 1198 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 CLCN6P51797 869 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 DYNLT1P63172 113 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 ABI1Q8IZP0 508 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 REREQ9P2R6 1566 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRD1A4D1F6 860 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC7A5Q01650 507 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 MYO1EQ12965 1108 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 PDIA5Q14554 519 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 SFNP31947 248 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 MAPK6Q16659 721 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF394Q53GI3 561 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 KLRK1P26718 216 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNB1Q14721 858 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 RGL1Q9NZL6 768 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 MEGF6O75095 1541 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 TCP11Q8WWU5 503 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL14Q9P2G3 628 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ITKQ08881 620 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM167AQ96KS9 214 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 HPS3Q969F9 1004 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 PDHBP11177 359 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 DPF2Q92785 391 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 OTUD5Q96G74 571 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 HMGCS2P54868 508 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ACAD9Q9H845 621 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 PALMO75781 387 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMC5P62195 406 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 SEMA3FQ13275 785 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF181Q9P0P0 153 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 NYAP2Q9P242 653 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 FDX1P10109 184 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 IFNAR2P48551 515 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 GMNNO75496 209 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 USP27XA6NNY8 438 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 SRGAP2O75044 1071 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 ENTPD3O75355 529 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 FGGP02679 453 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRJ-208ENST00000615445 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
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