RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PODNQ7Z5L7 613 aa17.9■□□□□ 0.46
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM49CP0CI26 452 aa17.9■□□□□ 0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE1BQ01064 536 aa17.9■□□□□ 0.46
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMED2Q15363 201 aa17.9■□□□□ 0.46
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPP2Q13103 211 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BBS9Q3SYG4 887 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MSTO1Q9BUK6 570 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM9Q9C026 710 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCND2P30279 289 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RCSD1Q6JBY9 416 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 E2F5Q15329 346 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP61Q8NHU2 1237 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP4R1Q8TF05 950 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANAPC7Q9UJX3 599 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NTSR2O95665 410 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR6B2Q6IFH4 312 aa17.88■□□□□ 0.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XXYLT1Q8NBI6 393 aa17.88■□□□□ 0.45
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