RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619590.1

AMD1-208, Transcript of adenosylmethionine decarboxylase 1, human

TSL 2

Gene AMD1, Length 4,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AMD1-208	ENST00000619590	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	C7	P10643	843 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	FCER1A	P12319	257 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	LRRC41	Q15345	812 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	DPP9	Q86TI2	863 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ACCS	Q96QU6	501 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	MMP19	Q99542	508 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	LAMB1	P07942	1786 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	MYMK	A6NI61	221 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590		M0R2N6	131 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	POTEJ	P0CG39	1038 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	KRT31	Q15323	416 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	CAGE1	Q8TC20	777 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	CEP170P1	Q96L14	293 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	JADE2	Q9NQC1	790 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ASB14	A6NK59	587 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	NFIB	O00712	420 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	NR2F2	P24468	414 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	VGLL4	Q14135	290 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	PADI6	Q6TGC4	694 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	LILRB3	O75022	631 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	GTF2A2	P52657	109 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	PPIL2	Q13356	520 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SFR1	Q86XK3	245 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	FAM167A	Q96KS9	214 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	TCHP	Q9BT92	498 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	GLTPD2	A6NH11	291 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	CHMP4BP1	P59074	171 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	GNG11	P61952	73 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	IQCE	Q6IPM2	695 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	PXMP2	Q9NR77	195 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	RGL1	Q9NZL6	768 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590		A0A087X0B3	334 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	KRT86	O43790	486 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	BCR	P11274	1271 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	IL17A	Q16552	155 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	DNER	Q8NFT8	737 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	SLC5A5	Q92911	643 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	C12orf42	Q96LP6	360 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	GBP3	Q9H0R5	595 aa		6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	LGALS16	A8MUM7	142 aa		6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	FAM86B1	E9PN63	330 aa		6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	COBL	O75128	1261 aa		6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	LRMP	Q12912	555 aa		6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	PPP2R5C	Q13362	524 aa		6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
AMD1-208	ENST00000619590	OPTN	Q96CV9	577 aa		6.96	□□□□□ -1.29

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