RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 C1QTNF8P60827 252 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 GNG11P61952 73 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 PGM5Q15124 567 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 LXNQ9BS40 222 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.05□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 CETN3O15182 167 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFA10O95299 355 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 HOXD13P35453 343 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF131P52739 623 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 FKBP1BP68106 108 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 CDK17Q00537 523 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ADAM9Q13443 819 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD7Q92527 254 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ERO1AQ96HE7 468 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 WDR24Q96S15 920 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 PXMP2Q9NR77 195 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 RNF146Q9NTX7 359 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 RIPK3Q9Y572 518 aa9.05□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ARID2Q68CP9 1835 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ATP2A1O14983 1001 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB39O15060 712 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 MYBP10242 640 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 MTMR1Q13613 665 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 COG2Q14746 738 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 RMDN3Q96TC7 470 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.04□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 MYPNQ86TC9 1320 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0U1RQJ8 604 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 FAM13AO94988 1023 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 GCNT3O95395 438 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 NR2F2P24468 414 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 GUCY2CP25092 1073 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 CASQ1P31415 396 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 HUNKP57058 714 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 NSMFQ6X4W1 530 aa9.04□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 BANK1Q8NDB2 785 aa9.04□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 PARVGQ9HBI0 331 aa9.04□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 ASTN1O14525 1302 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 UBE4BO95155 1302 aa9.03□□□□□ -0.96
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PDE4D-208ENST00000502484 ERCC3P19447 782 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 KCNMA1Q12791 1236 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 MYCT1Q8N699 235 aa9.03□□□□□ -0.96
PDE4D-208ENST00000502484 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
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