RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, human

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX17-208	ENST00000493711	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	PPME1	Q9Y570	386 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	SLITRK3	O94933	977 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	GJB1	P08034	283 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	GRIN1	Q05586	938 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	SORBS3	O60504	671 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	MBD3	O95983	291 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	LGALS2	P05162	132 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	LXN	Q9BS40	222 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SNX17-208	ENST00000493711	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		13.9	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711		H3BRB1	525 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	MED24	O75448	989 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	PGK1	P00558	417 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	MYL3	P08590	195 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	PFKFB1	P16118	471 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	CDC25A	P30304	524 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	SYK	P43405	635 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	LRRC41	Q15345	812 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	MTFR1	Q15390	333 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711		A0A1B0GVL5	298 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	DNM1L	O00429	736 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	CTAGE5	O15320	804 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	HBP1	O60381	514 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	SGPL1	O95470	568 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	F2	P00734	622 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	OAT	P04181	439 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	STAT6	P42226	847 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	PRKCE	Q02156	737 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	GRB10	Q13322	594 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	USP49	Q70CQ1	688 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SNX17-208	ENST00000493711	PCYT2	Q99447	389 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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