RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 GOLGA6DP0CG33 693 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 CACNB3P54284 484 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 NFIAQ12857 509 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 ARSHQ5FYA8 562 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 FRMD5Q7Z6J6 570 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 IDI2Q9BXS1 227 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 PALMO75781 387 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 SLC20A2Q08357 652 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 IFT20Q8IY31 132 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 PLCB1Q9NQ66 1216 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 GRIN3BO60391 1043 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 PPFIA4O75335 1185 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 SLC7A5Q01650 507 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 KCNH2Q12809 1159 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 Q4G0T1 1027 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 MEI1Q5TIA1 1274 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 TRERF1Q96PN7 1200 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 EHD2Q9NZN4 543 aa28.4■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 MYO1CO00159 1063 aa28.39■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 EPB41P11171 864 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 PPFIA1Q13136 1202 aa28.39■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 GBP6Q6ZN66 633 aa28.39■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 GPC2Q8N158 579 aa28.39■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 ETNPPLQ8TBG4 499 aa28.39■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 CES2O00748 559 aa28.39■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 NR2F2P24468 414 aa28.39■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 KLRC1P26715 233 aa28.39■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 ARHGAP4P98171 946 aa28.39■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 SLFN13Q68D06 897 aa28.39■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 MICALL2Q8IY33 904 aa28.39■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 KANSL2Q9H9L4 492 aa28.39■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 MEIS2O14770 477 aa28.38■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 SPIRE1Q08AE8 756 aa28.38■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 GDF3Q9NR23 364 aa28.38■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.38■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 DNM3Q9UQ16 869 aa28.38■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 A0A087X0T9 212 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 POTEFA5A3E0 1075 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 HSF2BPO75031 334 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 NPM3O75607 178 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 FAM228BP0C875 321 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 POTEIP0CG38 1075 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 RPA1P27694 616 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 STAT3P40763 770 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 GIT2Q14161 759 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 POTEGQ6S5H5 508 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 FAM133AQ8N9E0 248 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 ATP8B3O60423 1300 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 CALUO43852 315 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 FOSP01100 380 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 ANXA13P27216 316 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 TCP10Q12799 353 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 CATSPER3Q86XQ3 398 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 PDXKO00764 312 aa28.36■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 AFPP02771 609 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 MS4A14Q96JA4 679 aa28.36■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 FAM20AQ96MK3 541 aa28.36■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 RUFY1Q96T51 708 aa28.36■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 ZHX3Q9H4I2 956 aa28.36■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 DNAJC18Q9H819 358 aa28.36■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 CLRN2A0PK11 232 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 WNT10BO00744 389 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 PAK2Q13177 524 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 KCTD17Q8N5Z5 321 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 AMNQ9BXJ7 453 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 APBA1Q02410 837 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 BMT2Q1RMZ1 405 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 FOXR1Q6PIV2 292 aa28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
OPN3-204ENST00000469376 RASSF4Q9H2L5 321 aa28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms