RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466247.1

RBM6-215, Transcript of RNA binding motif protein 6, human

TSL 2

Gene RBM6, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM6-215	ENST00000466247	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	6.31	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	IGFALS	P35858	605 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	EFEMP1	Q12805	493 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	SPATS1	Q496A3	300 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	AJUBA	Q96IF1	538 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	INCENP	Q9NQS7	918 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	GALNT8	Q9NY28	637 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	BTBD7	Q9P203	1132 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	TLDC2	A0PJX2	215 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247		M0R2C6	588 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	B4GALT4	O60513	344 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	HIP1R	O75146	1068 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	RFPL3	O75679	317 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	ASL	P04424	464 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	MME	P08473	750 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	PPP2CB	P62714	309 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	PPP2CA	P67775	309 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF827	Q17R98	1081 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	TM4SF20	Q53R12	229 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	CUTA	O60888	179 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	JMJD7	P0C870	316 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	POLD1	P28340	1107 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	MC4R	P32245	332 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	CSF2RB	P32927	897 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	EPHB4	P54760	987 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	IRF9	Q00978	393 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	DLG3	Q92796	817 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	GBP4	Q96PP9	640 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	BOC	Q9BWV1	1114 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	KATNBL1	Q9H079	304 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	JADE2	Q9NQC1	790 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM6-215	ENST00000466247	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	ENPP3	O14638	875 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	FOXP2	O15409	715 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	KRT37	O76014	449 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	ADRB1	P08588	477 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	SDHA	P31040	664 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	IL13RA1	P78552	427 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	ASB15	Q8WXK1	588 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	NINJ1	Q92982	152 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	LOXL4	Q96JB6	756 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	SAMD11	Q96NU1	681 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	BTBD2	Q9BX70	525 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	ASB1	Q9Y576	335 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	MPIG6B	O95866	241 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	FLT3	P36888	993 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	ECE1	P42892	770 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	NIM1K	Q8IY84	436 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	CHST14	Q8NCH0	376 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	HIPK4	Q8NE63	616 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	WDR48	Q8TAF3	677 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	WNK4	Q96J92	1243 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	FEZ1	Q99689	392 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	AMN	Q9BXJ7	453 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	CABP5	Q9NP86	173 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	FBXO10	Q9UK96	956 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	FAM83G	A6ND36	823 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	RASSF10	A6NK89	507 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM6-215	ENST00000466247	TRAF5	O00463	557 aa		6.25	□□□□□ -1.41

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