RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591265.1

ZNF554-204, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ZNF554, Length 1,148 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-204ENST00000591265 BRF1Q92994 677 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 DCXO43602 365 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 SEMA3FQ13275 785 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 PIK3CDO00329 1044 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 SEC24BO95487 1268 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 ARHGAP4P98171 946 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 ZP2Q05996 745 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 KCNH6Q9H252 994 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ZNF554-204ENST00000591265 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 CHRNA1P02708 482 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 RXRAP19793 462 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 BMPR1AP36894 532 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 EVCP57679 992 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 APOBRQ0VD83 1088 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 ANKRD1Q15327 319 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 NLRX1Q86UT6 975 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 TRIM50Q86XT4 487 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 CUL5Q93034 780 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 CLDND1Q9NY35 253 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 NID2Q14112 1375 aa20.32■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 CTNNB1P35222 781 aa20.31■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 RSPH3Q86UC2 560 aa20.31■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.31■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 CDHR1Q96JP9 859 aa20.31■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.3■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 LINC00271P0C7V0 271 aa20.3■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 LTBRP36941 435 aa20.3■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.3■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 PLVAPQ9BX97 442 aa20.3■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 ENPP3O14638 875 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 MEIS2O14770 477 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 MGAT3Q09327 533 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 GPRASP2Q96D09 838 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 UIMC1Q96RL1 719 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 GHRP10912 638 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 LPIN1Q14693 890 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 SQORQ9Y6N5 450 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 GRM6O15303 877 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 MAFGO15525 162 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 SP4Q02446 784 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 HYAL1Q12794 435 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 PPFIA1Q13136 1202 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF554-204ENST00000591265 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
ZNF554-204ENST00000591265 DGKIO75912 1065 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-204ENST00000591265 MMP1P03956 469 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-204ENST00000591265 KCNA2P16389 499 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-204ENST00000591265 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-204ENST00000591265 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-204ENST00000591265 GRIK4Q16099 956 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-204ENST00000591265 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-204ENST00000591265 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms