RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18.89■□□□□ 0.62
PTDSS1-202ENST00000517309 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa18.89■□□□□ 0.62
PTDSS1-202ENST00000517309 QRICH1Q2TAL8 776 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 C12orf60Q5U649 245 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 C7orf31Q8N865 590 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM114A2Q9NRY5 505 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP17L15C9J2P7 530 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP17L11C9JVI0 530 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP17L18D6R9N7 530 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP17L22D6RA61 530 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP17L19D6RCP7 530 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP17L20D6RJB6 530 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 GFPT2O94808 682 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PHKA2P46019 1235 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP17L24Q0WX57 530 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP17L6PQ6QN14 398 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM170AA1A519 330 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 ARHGAP25P42331 645 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 CEP57Q86XR8 500 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 VSTM4Q8IW00 320 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM133AQ8N9E0 248 aa18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM196BA6NMK8 535 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 P4HBP07237 508 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 SEL1LQ9UBV2 794 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 TACC3Q9Y6A5 838 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 GOLGA8KD6RF30 607 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 CSF1RP07333 972 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 MARK3P27448 753 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF131P52739 623 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PADI6Q6TGC4 694 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 POTEDQ86YR6 584 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP11P51784 963 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PTPROQ16827 1216 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 HOXD10P28358 340 aa18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 TCP11X2Q5H9J9 407 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC35F6Q8N357 371 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 OSTNP61366 133 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF667Q5HYK9 610 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 RABGGTAQ92696 567 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PANX2Q96RD6 677 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 NCAPGQ9BPX3 1015 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 ANXA13P27216 316 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PBKQ96KB5 322 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 BCAP29Q9UHQ4 241 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PTPRMP28827 1452 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 CLDN3O15551 220 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 NMT2O60551 498 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 ENTPD3O75355 529 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 MYL3P08590 195 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 STAT3P40763 770 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 XXYLT1Q8NBI6 393 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 CCHCR1Q8TD31 782 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 MCF2LO15068 1137 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 OAS2P29728 719 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 RASSF2P50749 326 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 OR6B2Q6IFH4 312 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 DSTYKQ6XUX3 929 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 RAD54LQ92698 747 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa18.87■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 SBK1Q52WX2 424 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 ADGRF4Q8IZF3 695 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD42Q8N9B4 389 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 FCER1AP12319 257 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 POTEMA6NI47 508 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 NOL3O60936 208 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 KRT10P13645 584 aa18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTDSS1-202ENST00000517309 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms