RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC125Q86Z20 511 aa18■□□□□ 0.47
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX3P56589 373 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DYNLT1P63172 113 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNC13DQ70J99 1090 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 P3H4Q92791 437 aa18■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF34Q8IZ26 560 aa17.98■□□□□ 0.47
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BPIFB4P59827 614 aa17.98■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.475e-7■■■■□ 24.6
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM50Q86XT4 487 aa17.98■□□□□ 0.47
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa17.98■□□□□ 0.47
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POTEIP0CG38 1075 aa17.98■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POTEGQ6S5H5 508 aa17.98■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.98■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB33Q86T24 672 aa17.98■□□□□ 0.47
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.97■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSF1RP07333 972 aa17.97■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.474e-7■■■□□ 16.7
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR19Q8NEZ3 1342 aa17.97■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.97■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDXDC2PQ6P474 469 aa17.97■□□□□ 0.47
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.97■□□□□ 0.47
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAT3P40763 770 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF394Q53GI3 561 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C7orf31Q8N865 590 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM206Q9H813 350 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TXNDC9O14530 226 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NNTQ13423 1086 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC12A2P55011 1212 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKT3Q9Y243 479 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PXDNQ92626 1479 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GIPC1O14908 333 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CALN1Q9BXU9 219 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BARHL2Q9NY43 387 aa17.96■□□□□ 0.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ESYT3A0FGR9 886 aa17.95■□□□□ 0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PALMO75781 387 aa17.95■□□□□ 0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGGP02679 453 aa17.95■□□□□ 0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MARK3P27448 753 aa17.95■□□□□ 0.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GABPAQ06546 454 aa17.95■□□□□ 0.46
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