RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460981.1

REV3L-208, Transcript of REV3 like, DNA directed polymerase zeta catalytic subunit, human

TSL 2

Gene REV3L, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REV3L-208	ENST00000460981	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	TGM1	P22735	817 aa		6.31	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		6.31	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		6.31	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		6.31	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	CEP89	Q96ST8	783 aa		6.31	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		6.31	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		6.31	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	COL6A2	P12110	1019 aa		6.3	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	MCM7	P33993	719 aa		6.3	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	RNF151	Q2KHN1	245 aa		6.3	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		6.3	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	CR2	P20023	1033 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	POLD1	P28340	1107 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	PPP2R2A	P63151	447 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	TNNI3K	Q59H18	835 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF575	Q86XF7	245 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	C8orf37	Q96NL8	207 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		6.29	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	ACOT7	O00154	380 aa		6.28	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	DLX3	O60479	287 aa		6.28	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	EPHA5	P54756	1037 aa		6.28	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		6.28	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		6.28	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	GML	Q99445	158 aa		6.28	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	IER2	Q9BTL4	223 aa		6.28	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		6.28	□□□□□ -1.4
REV3L-208	ENST00000460981	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	CUTA	O60888	179 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	C1S	P09871	688 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	GNAT1	P11488	350 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	GRK2	P25098	689 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	GRK3	P35626	688 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	FXN	Q16595	210 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	LBX2	Q6XYB7	198 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	USP53	Q70EK8	1073 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	IL17D	Q8TAD2	202 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	KCNJ15	Q99712	375 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	EPN3	Q9H201	632 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	DSE	Q9UL01	958 aa		6.27	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981		A0A1W2PQU0	124 aa		6.26	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	ESYT3	A0FGR9	886 aa		6.26	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	DUSP8	Q13202	625 aa		6.26	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		6.26	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		6.26	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		6.26	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		6.26	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	MATN2	O00339	956 aa		6.25	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	CDC14B	O60729	498 aa		6.25	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		6.25	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		6.25	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	KCTD1	Q719H9	257 aa		6.25	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		6.25	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	FAM89A	Q96GI7	184 aa		6.25	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	OR14A2	Q96R54	314 aa		6.25	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		6.25	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981		A0A087X1B8	175 aa		6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	AGRP	O00253	132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	GJB6	O95452	261 aa		6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	ACRV1	P26436	265 aa		6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	RRAD	P55042	308 aa		6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	INHBC	P55103	352 aa		6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	DCAF4	Q8WV16	495 aa		6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	NR2E1	Q9Y466	385 aa		6.24	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	TBR1	Q16650	682 aa		6.23	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		6.23	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	SCYL1	Q96KG9	808 aa		6.23	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	ETV4	P43268	484 aa		6.22	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	NFYC	Q13952	458 aa		6.22	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	NTRK3	Q16288	839 aa		6.22	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.22	□□□□□ -1.41
REV3L-208	ENST00000460981	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		6.22	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms