RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 GP6Q9HCN6 339 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOCK2Q92608 1830 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAMB1P07942 1786 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL16Q14005 1332 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHISA3A0PJX4 238 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 YDJCA8MPS7 323 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 FZD9O00144 591 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 UFL1O94874 794 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV5-2P06315 115 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITIH2P19823 946 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPSM2P81274 684 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEXNQ0ZGT2 675 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRM1Q13255 1194 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCEAL1Q15170 157 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTERF2Q49AM1 385 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDHDQ86WU2 507 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPC2Q8N158 579 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 LILRB2Q8N423 598 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 APBA2Q99767 749 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST14Q9Y5Y6 855 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYH2Q9UKX2 1941 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTL9Q8NET4 1388 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAF5O00463 557 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP26A1O43174 497 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECE2O60344 883 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 TGFB1P01137 390 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEACAM5P06731 702 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRFP11831 508 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPS15P42566 896 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF445P59923 1031 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SV2CQ496J9 727 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC152Q4G0S7 254 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC10A5Q5PT55 438 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC191Q8NCU4 936 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRF1Q92994 677 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 LGR4Q9BXB1 951 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPN3Q9H201 632 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 GREM2Q9H772 168 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 WHRNQ9P202 907 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATAD5Q96QE3 1844 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNTNAP1P78357 1384 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDHR2Q9BYE9 1310 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 TLDC2A0PJX2 215 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 WASH4PA8MWX3 477 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD14O00487 310 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIGLEC6O43699 453 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE8AO60658 829 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGA4P13612 1032 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXCL9Q07325 125 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 KSR2Q6VAB6 950 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SP8Q8IXZ3 490 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q8N3U1 123 aa5.57□□□□□ -1.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUPT20HQ8NEM7 779 aa5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms