RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 KIF20AO95235 890 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SLC25A27O95847 323 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 P4HBP07237 508 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 PMS1P54277 932 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 HERVK_113P62684 666 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 COASYQ13057 564 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SNAPC2Q13487 334 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 PLS1Q14651 629 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 TCP11X2Q5H9J9 407 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 FAM26FQ5R3K3 315 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 ANKRD40Q6AI12 368 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 MIER3Q7Z3K6 550 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 TMC6Q7Z403 805 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 IRF2BP1Q8IU81 584 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 TPH2Q8IWU9 490 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 DNERQ8NFT8 737 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 RDM1Q8NG50 284 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 CDHR1Q96JP9 859 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SENP7Q9BQF6 1050 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SPATC1LQ9H0A9 340 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SLC39A2Q9NP94 309 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 INTS13Q9NVM9 706 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 KCND2Q9NZV8 630 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 PFASO15067 1338 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 PHIPQ8WWQ0 1821 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 KCNJ18B7U540 433 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 CHMP2AO43633 222 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 GAP43P17677 238 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SFNP31947 248 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 PBX1P40424 430 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 JAK3P52333 1124 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 COPB1P53618 953 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 KRT76Q01546 638 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 CYP4A11Q02928 519 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 LRRC63Q05C16 580 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 KCNJ12Q14500 433 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 KRT31Q15323 416 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 RINT1Q6NUQ1 792 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 C1orf186Q6ZWK4 172 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 FAM114A1Q8IWE2 563 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 ANKRD35Q8N283 1001 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 CCDC150Q8NCX0 1101 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 KIAA1524Q8TCG1 905 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 HPS3Q969F9 1004 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 TRIM47Q96LD4 638 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 BHMT2Q9H2M3 363 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 RRAGCQ9HB90 399 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 RBPJLQ9UBG7 517 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 WDR90Q96KV7 1748 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 NFASCO94856 1347 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 TRIM49BA6NDI0 452 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 ATP9AO75110 1047 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 COBLO75128 1261 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 POTEJP0CG39 1038 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 ICAM3P32942 547 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 GJA5P36382 358 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 STXBP2Q15833 593 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 C4orf19Q8IY42 314 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 SCN4AP35499 1836 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 RLFQ13129 1914 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 WDR64B1ANS9 1081 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 B4DLN1 442 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 POTEB2H3BUK9 544 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
CS-209ENST00000547449 TRAF5O00463 557 aa10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.8 ms